与埃及神话中的九柱神相似，玛雅神话中也有因为地位尊崇而受到敬仰的九位神祗，俗称玛雅九联神。他们分别代表古玛雅人对于九种自然元素的敬畏之意，九位神祗有善有恶，都拥有强大的力量。
1.伊特萨姆纳主神：万神之首。在手抄本中，天神伊特萨姆纳被描绘成一个没牙的，两颊凹陷的老男人。
2.雨神恰克：善神，主宰雨水与东西南北四方。由于雨水与农业有着密不可分的关系，因此恰克也被称为农业守护神
3.玉米神尤姆·卡克斯：同样是一位善神，和雨神恰克常常一起合作为人们带来收获。
4.死神阿·普切：玛雅神话中的恶神，喜欢与战神一起出现，战神负责夺取人们性命，死神负责将他们引领到死亡世界。
5.风神库库尔坎：做为玛雅神话后期几乎占有统治地位的羽蛇神，初期的库库尔坎却是做为风神出现，而且在各种手抄本中很少被人提及，其形象也不是长着羽毛的蛇，而且一个手持法杖的中年男子。
6.暴死、人祭、战斗之神柯卡塔：在人祭的场景中柯卡塔常与阿•普切一起出现，他被描绘成一只手上的火把点燃房屋，而用另一只手上的长矛捣毁敌人的残酷形象。
7.北极星神萨曼·埃克：一位善神，由于北极星终身不变位置，因此他也被称为商旅向导。
8.分娩与纺织女神伊斯切尔：伊特萨姆纳之妻，拥有急燥和友善两张面孔。她也是妇女们的守护神，负责保护分娩妇女和新生儿的安全，同时还将纺织手艺传给了玛雅人。
9.自杀神伊斯塔布：由于古玛雅视自杀为通往天堂之路，因此伊斯塔布也被称为天堂领路人。
除了上述9位主要的神，玛雅人还有其他的神。例如，玛雅人将世界分为13层上天和9层下界，每层上天和每层下界都有自己的神;玛雅人将一年分为19个月，每月也有代表神。