南北朝时南朝御史台在尚书省之南，称南台，因称南台之长御史中丞为“南司”。

《梁书·江淹传》：“少帝初，以本官兼御史中丞。时明帝作相，因谓淹曰：‘君昔在尚书中，非公事不妄行，在官宽猛能折衷。今为南司，足以震肃百寮。’”《南史·何敬容传》：“帝大怒，付南司推劾，御史中丞张綰奏敬容协私罔上，合弃市。”《通典·职官六》：“自齐、梁皆谓御史中丞为南司。”

唐时中书、门下、尚书三省均在大内(皇宫)南面，故称“南衙”，亦称“南司”。

《旧唐书·宋申锡传》：“会内官马存亮同入，諍於文宗曰：‘谋反者适宋申锡耳，何不召南司会议。’”